进入新世纪之后，根据国外先进导弹发展和机载综合电子战系统发展趋势，歼-10A改进型歼-10B、歼-10C两种战斗机机载综合电子战系统又有较大改进和提高，首先新系统性能有进一步提高，如雷达告警系统可以提供更加精确辐射源定位精度，可以让主动干扰机干扰指向更加精确，甚至可以支持反辐射导弹进行远距离防空压制，干扰机干扰和压制手段更加多样化，需要指出，中国新一代综合电子战系统加强了前向威胁告警和干扰，这也是新一代电子战系统一个典型特点，这是因为主动雷达制导空空导弹迎头拦截射程最远，所以战斗机要加强前向威胁告警和干扰。
国产新一代综合电子战系统还在功能进行了扩展，这也是新一代电子战系统发展趋势，首先它可以配备电子干扰吊舱，对于战斗机电子战系统来说，考虑到功率、体积等因素，它主要目标是对方火控和制导雷达，对于预警、搜索雷达着力不多，因此新一代综合电子战系统通过加装电子干扰吊舱来对抗对方这些雷达，以提高战斗机生存能力，它还配备了光电探测系统和对抗系统，包括紫外/红外导弹逼近告警系统、激光告警系统、光电干扰系统等，可以对抗新一代红外制导空空导弹。