改组后的国土战略防御攻击与后勤保障局的局长，也将由世界安全理事会任命，神盾局对它的完全掌控受到了削弱，现在的局长独眼龙尼克·弗瑞便并非神盾局人员。
所以，为了保证对国土战略防御攻击与后勤保障局的控制，神盾局加强了对中下层人员和机构的掌控力度，除了原本就已经占据关键位置的众多神盾局人员外，又陆续派入了包括娜塔莎·罗曼诺夫在内的大量人手，强化了对国土战略防御攻击与后勤保障局各个部门的控制，始终将它牢牢地控制在手中。
所以，虽然尼克·弗瑞虽然是世界安全理事会任命的局长，看似完全掌控着国土战略防御攻击与后勤保障局，但其实它的真正掌控者一直都是神盾局！