当日下午，针对刘元利妻女自尽一事而引发的圣旨从宫中发出，随即在厂卫内部引起巨大的震动。
锦衣亲军第三千户所千户梁琦徇私枉法、致死人命，斩立决，家产抄没，首级传看亲军，于此案有牵连者皆斩。
锦衣亲军指挥同知齐昌国赐死，罪不及家人。
锦衣亲军都指挥使骆养性御下不严、失察，罢都指挥使一职，仅保留左都督一职，其职位由都督佥事、北镇抚司镇抚使李若链接任。
西城千户所千户李烈久历功勋，特擢为北镇抚司镇抚使一职。
南镇抚司镇抚使王正元病退荣养。
擢程千里为锦衣亲军都督佥事、南镇抚司镇抚使一职。
司礼监秉笔太监方正化任提督东缉事厂太监，卢九德改任司礼监随堂太监，掌刑千户王世勤罚奉一年，暂代职位，视后情酌情任用。
这一连串重大的人事调整和变动里，透露着皇帝对厂卫的现况已是极度不满，同时也给行事日渐骄横的某些人当头一棒。
随着梁琦的首级被传看于京师各卫所之中，亲军上下无不震怖异常。很多人终于再次意识到，自己的权势地位、富贵荣华，都是依附在皇权之下的，只要触怒了皇帝，任你再权势滔天，眨眼间便会成为冢中枯骨。
新上任的李若链随即在亲军内部展开了一场持续一月的大清洗，将一些贪得无厌的害群之马彻底扫除，许多对皇家忠诚无比、能力出众的中低层将官校尉得到了拔擢。经过这场运动，已现腐朽之气的亲军再次焕发出了勃勃生机。
就在一切井然有序进行的时候，朱由检收到了曲阜知县庄元洲的密奏。
在这封密奏中，庄元洲把自己领会到的圣意以及想要采取的策略做了详细的陈述，并请求得到宫里的大力支持。