由于苻登的出色表现，被认为是前秦的希望，因此前秦将帅商议欲立苻登继任皇帝位，于是乎苻丕的尚书寇遗带着苻丕之子渤海王苻懿、济北王苻昶从杏城来投奔苻登。
苻登得知苻丕的死讯，于是为苻丕发丧穿孝服守孝，三军都穿白色丧服。
因为苻懿是苻丕的幼子，因此苻登建议立苻懿为主，但是众人都说：“渤海王虽然是先帝之子，但是年纪太小，不堪承担多难之事。国乱而立年长之君，是《春秋》所载。三虏相连僭称帝号，贼军强盛，豺狼忘恩负义之人，到处都是，自古以来极端的厄运，没有比现在更厉害的了。大王在西州作战，如凤鸟在秦、陇飞翔，偏师一接战，姚苌溃逃，一战之功，可说是光照天地。应当如龙飞跃奋发武威，拯救旧都，以社稷宗庙为先，不可只顾曹臧、吴札那样的微末节义，而失去谋取国运之机，不建复兴帝业之业。”
见群臣这么说，苻登也不再推辞，于是便在南安即皇帝位，在境内大赦，追谥苻丕为哀平皇帝，改年号为太初，以明年为太初元年。
苻登即位后，立苻丕的幼子苻懿为皇太弟。派使者拜苻纂为使持节、侍中、都督中外诸军事、太师，领大司马，进封为鲁王，苻纂弟苻师奴为抚军大将军、并州牧、朔方公。
即位后的苻登，因一直仰慕老上司毛兴的女儿毛秋睛，因此在登上皇帝位后便迎取娶毛秋睛为妻，同时立她为皇后。