然而，在决定田地等级的时候，奉行人若是按照日照以及水利情况将田地定为上等，就会与村民产生极大的矛盾。虽说领主与领民的身份区别极大，领民的主张也有很大可能不被接受，但是总的来说制作出来的检地账也是经由双方利益碰撞之后所定下来的，所以领民也对检地账中的相关内容是负有责任的。
表面上年贡额一般来说以村高为基准，再乘以几成、几分这样的年贡率，以村落为单位进行计算，针对村落征收年贡。而长百姓、肝煎等村吏也以此为标准，根据每一个村民的承担额进行分别征收，集齐全村的年贡额之后再上缴给领主。
若是遇到有无法缴纳的领民，长百姓、肝煎等村吏可以暂时进行垫付，总之要备齐全村的年贡额后再一次上缴。
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