在那之后，他应李时珍之邀在北洋研究院待过一段，又去遵化教授矿工辨别矿脉，回到南方便留在南京为三所匠学的矿工、山主教授学问。
北洋停在长江口的战舰就是他叫来的，此时与他一同饮酒的还有七名匠学生。作为优秀的匠学讲师，方学渐自掏腰包带他没见过世面的学生到画舫上喝花酒。
“我一直告诉诸位要学好西语，是因为在翻译《矿冶全书》时许多矿冶之事我并不懂，直至前往北洋遵化铁厂观之实用，这才知道孰优孰劣，倘若当时翻译书籍的是你们，也许这本书会比如今更好。”
“西人之鼓风、高炉不值一提，冶炼金银铜铁的手艺甚至不如古代，他们只知世间有倭铅却不知是怎么来的；不过细枝末节亦有可取之处，诸如辨矿鉴别，记载诸矿石之颜色、软硬、贫富数不胜数，实令我辈耳目一新。”
“除此之外还有其分离金银之混汞法、强水法，为我天朝闻所未闻，你等此番受我举荐入北洋军府，今后兴许可接触更多西书，一定要早日编撰出融贯寰宇之书，到那时国朝方有真正的《矿冶全书》，诸位亦可不负我将毕生所学倾囊相授矣！”