得更多的上场机会，被租借到勒沃库森足球俱乐部，为期一年半。2009年12月19日在勒沃库森三比二战胜门兴格拉德巴赫的比赛中，克罗斯第一次在德甲联赛中梅开二度，帮助球队取得德甲冬歇期冠军。2009年12月及2010年1月克罗斯连续被德国足球杂志《踢球者》评选为当月最佳球员;还连续三周当选《踢球者》评选的单轮最佳，成为德甲历史上第一位荣获该项殊荣的球员。
2010年6月30日克罗斯租借到期回归拜仁慕尼黑，在一年半的租借期间，克罗斯从替补成为了拜仁不可或缺的主力，其技术与自信心的得到明显的提升。2011年09月15日欧洲冠军联赛a组首轮拜仁客场二比零力挫比利亚雷亚尔的比赛中，克罗斯接到队友弗兰克·里贝里助攻，攻入一球，其后又助攻队友马西奥·拉斐尔得分。