在宫古岛的后续行动持续的时间远比战事进行的时间更长，兵力有限的海汉军要对面积超过150平方公里的宫古岛和紧邻的下地岛、伊良部岛、来间岛、池间岛、大神岛等岛屿进行清理，着实是费时费力的行动。而岛上的俘虏、大部分原住民，以及大量的物资，都需要用船运回海汉自己的地方去。届时交还给琉球国的，大概也就只是一个光秃秃的岛屿了。
海汉在宫古岛上缴获的财富就远不及去年在澎湖的收获了，主要的原因也是因为十八芝撤到宫古岛之后生计日益艰难，不得不拿出了大量积蓄购买各种物资补给，一年下来消耗极大。等海汉民团大举攻入岛上的时候，十八芝其实也已经到了强弩之末，就算不遭遇外敌也已经开始显露出颓势了，或许不会在短时间内自然消亡，但为了寻求资源，分裂成多个小规模武装团伙各自为战，几乎是必然会发生的状况。