第二年张让终于找到一个借口，将王允逮捕下狱，不久正好赶上朝廷大赦，王允免罪释放，还复刺史原职。</p>
可是睚眦必报的张让并没就此罢休，没出十天他又以另一个莫须有的罪名将王允治罪，王允再度入狱。</p>
司徒杨赐素知王允的为人和品性，知道张让是有意想置王允于死地，为了替王允开罪，让他免受痛苦和屈辱。</p>
杨赐派手下人劝告王允说，你因事得罪宦官张让，一月之内，两次下狱，很明显他是有意和你过不去。</p>
如今你是凶多吉少，性命都难保，为了成就自己的志向，你又何必不先退让一下，忍一忍呢，大丈夫能屈能伸，如果只一味好强，恐怕他不会放过你，请你仔细思量思量吧！</p>
王允手下的从事也对王允的再次入狱深感忧虑，他们想方设法营救王允，有一名好斗气的下属去狱中探望王允时，痛哭流涕，劝王允向张让认错赔罪，求他网开一面，被王允怒斥拒绝。</p>
下属找来一杯酒，气愤地对王允说，你既然如此保全自己，不如喝下这杯毒酒算了，又何必还在狱中受别人的折磨呢？</p>
可是出乎下属的意料，王允一把夺过酒杯，厉声说道我是堂堂天子的臣民，君王赐罪于我，我应当接受惩罚。</p>
按照王法在街头斩首示众，而且天下人都应以我为戒，不再违反法律，维护社会的安定，哪有私自吞喝毒药，以死逃避法律制裁的道理？</p>
你们不用再劝我了，我意已决，说完便把酒泼倒在地上，自己走近囚车，又重新被关进监狱。</p>
由于王允一直又没有向张让赔罪认错，张让又进一步渲染他的所谓的罪行情节，不久王允的案件被提审，王允的手下官员和朋友以及朝中许多官员都十分着急，想制止张让对王允的陷害。</p>
大将军何进、太尉袁隗，司徒杨赐联名向皇帝上书，替王允求情，希望汉灵帝能够赦免王允。</p>
他们在奏章中写道，王允严于律己，宽以待人，为官尽忠尽诚，宽宏贤能，具有君子的风范和气节。</p>
过去晋悼公和先朝孝文皇帝能明辨是非，赦免大臣的罪行，陛下就不能仿效吗，如此王允受命于朝廷，诛讨逆贼，安抚良民，本应论功行赏，加官进爵。</p>
难道就因如此微不足道的小事情，就定他死罪吗，陛下如此不公平地给予他处罚，恐怕有负众望，百官有所不服吧。</p>
灵帝刘宏看完奏章后，便赦免了王允的死罪，但仍下狱重新定罪，这年冬天又逢朝廷大赦。</p>
可惜由于张让始终从中作梗，王允仍不在赦免之列。何进、袁隗、杨赐等三公要员继续上书皇上，要求赦免王允。</p>
等到第二年王允才被免罪释放，当时朝中宦官当权，张让阉党凭借权势横行霸道，为所欲为。</p>
刚刚出狱的王允虽对张让等人的行径深恶痛绝，但因力量有限，只得改名换姓，离开都城洛阳，辗转于河内、陈留之间。</p>
不久灵帝驾崩，王允急忙赶赴洛阳吊丧，此时朝廷局势极度混乱，以何进为首的外戚势力大增，阉党张让失去了对中央政权的控制权，面临覆灭的危险。</p>
大将军何进利用各地方官吏奔丧的机会，大肆结交和拉拢亲己势力以谋张让，王允一到洛阳，就被何进紧急召见，并说明意图。</p>
王允很感激何进对他的救命之恩，便满口答应并担任从事从郎一职。</p>
后来情况发生急变，张让集结党羽，用何太后召见何进的名义把何进骗入宫中，趁机伏杀。王允不得不迁任河南尹，暂时逃避张让的嚣张气焰。</p>
张让伏杀何进后，曾奉密召的董卓、袁术等人立即领兵进京，讨杀张让，张让、段挂等人挟持少帝刘辩和陈留王刘协半夜出逃。</p>
当时朝中公卿大夫被急变的局势吓得不知所措，他们都不敢护卫少帝，王允立即派遣一部分士兵跟随尚书卢植一起保护少帝，事后，又奉迎少帝回宫。</p>
永汉元年董卓废掉少帝，献帝刘协继位，王允被拜为太仆，不久迁任尚书令，初平元年王允替代杨彪担任司徒职务，同时兼任尚书令。</p>
王允担任司徒，可谓是受命于危难之秋，献帝登极后，外戚、宦官斗争仍在继续，