变法对大明社会的改变，朱翊还感觉到中枢很多职能需要进一步加强。张居正当政时，临时差遣某官员专责某事的体例需要改变，有必要增加部门，进一步细化职责，使得中枢对地方的指挥更加的强而有力。 经过数月的深思熟虑，朱翊钧觉得有必要对中枢架构进行进一步调整——将变法八年来所积蓄的一些体制机制问题进一步改革，使得上层建筑与社会发展始终匹配。 因此，在山西局面稳定之后，朱翊钧在文华殿召开军政会议，提出深化中枢改革的想法，并把这项事作为张四维这个总理大臣任内的首要政治任务。 会上张四维接了任务——脑瓜子嗡嗡的。