新疆临时省政权首脑刘文龙吓得嚎啕大哭，要求辞去首脑一职。省府办公人员一致向黄慕松提出，收回撤除边防督办公署的计划。
盛才在暗中指示手下四处散布黄慕松与马英勾结，同时又公开宣布大西忠是日本的间谍，马英是日本帝国主义的走狗。言外之意，黄慕松与马英的接触实际上是在为日本帝国主义张目。
此言一出果然激起了被日本占领家园的东北义勇军的义愤。大部分留在新疆的东北义勇军卷入了内战。5000人在随后不到半年的战争中付出了宝贵的生命。
看到新疆的乱局，蒋界石和汪金卫忧心忡忡，纷纷发表了对新疆时局的看法。
7月10日，国民政权行政院长汪金卫提出了解决新疆问题的三大原则：第一，外交要统一于中央。第二，军事要统一于中央。第三，宗教要自由，民族要平等。
第二天，马英就致电国民政权，表示服从中央的指示。
20日，盛才、刘文龙也致电蒋界石和汪金卫，表示服从中央的原则。
8月1日，国民政权在行政院第118次会议上任命刘文龙为新疆省首脑，盛才兼边防督办，张元兼伊犁屯垦使及陆军新编第8师师长。
汪金卫的三条准则公布以后，马英寝食难安，因为其中根本没有提到他马英。
一天，他用淡黄色的眼珠盯着正在倒茶的牛占川问道：“你说汪院长的讲话到底是什么意思？”
牛占川不假思索地回答道：“地方服从中央，新疆实现和平呗。”
马英面带愁容地说道：“你看，中央正式承认了盛才的地位，同时也没有忘记远在伊犁的张元，唯独没有提及我们。这意味着我们是流寇和土匪啊。”
牛占川瞪着大眼睛骂道：“他们那些崽娃子才是流寇和土匪！我们是革命军新编第36师。”
盛才杀害陈中等3人震慑了迪化城里反对自己的异己分子，又软禁了中央特使黄慕松，又开始考虑对付自己的心腹大患马英。
马英在紫泥泉失败以后，退到吐鲁番养精蓄锐，一方面东出鄯善，围攻奇台；另一方面派遣马世明重返迪化近郊实行骚扰，同时命令进抵阿山（今天阿勒泰）附近的马黑鹰进逼塔城，还分出少量的兵力西去喀什，意在创造更大的地盘。
马世明返回迪化南山，派人刺杀了叛徒马德祥，纠集旧部再次骚扰迪化的郊区。
盛才调派东北义勇军和白俄军队在南山的水西沟一带围剿马世明，遭到了马世明的伏击，指挥刘快腿被击毙了。
迪化的局势再度紧张起来。
迫于内外的压力，盛才被迫假装和马英举行和平谈判，与兵困马乏的马英不谋而合。
双方的代表先后在吐鲁番和迪化多次会晤。其中，马英的代表张雅韶还与盛才在迪化彻夜长谈。
盛才提出任命马英为东疆警备总司令，指定哈密为他的军事防区。
张雅韶却提出南疆、北疆分治，马英占据南疆，盛才占据北疆，各不相犯。
双方的分歧很大。和谈一度陷于了僵局。
这时候的马英非常清楚，再固执己见则是师出无名。因此，态度一度强硬的马英突然转变了思想，完全接受了盛才提出的和平条件。
霍加尼牙孜归顺盛才的省军以后，仍然在托克逊县一带继续和马世明交战，被马世明一举歼灭了大半个军队，狼狈地退往南疆的焉耆县。
盛才见势不妙，连忙派人携带巨款赶去焉耆，犒赏霍加尼牙孜。
霍加尼牙孜的部下战斗力低下，是一团扶不上墙的烂泥，不久又被马世明击败，仓皇地逃往更加遥远的库车县。
马英对霍加尼牙孜进攻马世明感到十分恼怒，断定是盛才故意指使，因此借故不肯去哈密赴任。