但是一旦殿帅府设立之后，外相府要调动六百城的城防营，就得有殿帅府文书批准，否则，物资就无法调动。
此外吏相府也有部分权利损失。吏相府除了负责无双法律之外，还负有考察每个官员的职责，以便在适当时候任用提拔等等，但是殿帅府设立之后，鉴于军政权不在手里，所以关于六百城的城防营之类的任免手续，也依旧要有殿帅府的文书，否则，吏相府签发的官员调动任免文书只对文官有效，对武官无效。
至于内相府，也有权利损失，只是相对少一些。却也能在一定程度上节制殿帅府。损失在于，原本内相府的直属力量，武城营和灵城营，必须通过殿帅府管理。不过好处在于，一切府库的巡查，任何财货物资的调动，全部归内相府统帅。也就代表，殿帅府节制之下的所有军营，军需物资补给的运作，是内相府管理。
从这个角度来说，虽然地位低了半级，但是内相府，是唯一敢对殿帅府叫板的机构。