之后，崇祯皇帝又急檄新任的延绥总兵王洪、宁夏总兵祖大弼扼守在汉中、略阳、秦州、徽州一带，准备在流贼出川时加以堵截。
此时，围堵流贼的官军人数已有五六万人。
面对来势汹汹的官军，李自成等流贼见势不妙，遂又领着流贼大军北上逃窜，企图再度进入陕西。
双方在彰明、江油、龙安发生多次大战。
流贼依仗人数优势，终归是突破了官军的围追堵截，再度回到陕西。
而逃入河南的张献忠等流贼，此时也迎来了实力的大增长。
在有了高迎祥余部的投靠后，张献忠伙同闯塌天等流贼，共二十余万人沿江东下。
流贼大军经由六合、怀宁、望江、江浦，一度逼近扬州府。
南京留守司急忙调兵遣将，围堵流贼东上。
双方在望江、江浦大战。
最终，张献忠等流贼无功而返，掉头回返，返回了郧襄地区。
面对流贼势又复起的趋势，崇祯皇帝环顾身周廷臣，觉得无一人知晓军事。
于是，崇祯皇帝又想起了丁忧在家、曾经的宣大总督、杨鹤之子的杨嗣昌。
杨嗣昌在任宣大总督之时，曾多次击败鞑子的袭扰，并略有斩获。
在杨嗣昌的治理下，边地的百姓也因此得到短暂的安宁生活。
也正是如此，杨嗣昌懂军事的名声也传到了崇祯皇帝的耳中。
而后，崇祯皇帝不经朝臣的廷推，径直下旨起用杨嗣昌为兵部尚书。